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中外机构联建迄今为止最完整海洋微生物基因数据库 - 海洋地震研究机构

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  中新网广东新闻9月5日电 (记者 索有为)9月4日晚,华大生命科学研究院联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构,在全球顶级学术期刊《自然》(Nature)上发表了一项重磅研究成果:研究团队不仅构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,更从中发现了大量具有应用潜力的基因资源,为开发新型基因编辑工具、抗菌肽、PET塑料降解酶等提供了全新的思路。

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  研究团队历时五年,通过对已公开的近240 Tb海洋微生物宏基因组数据进行重分析,构建了拥有超4.31万个海洋微生物基因组和24.58亿个基因序列的海洋微生物组数据库The Global Ocean Microbiome Catalogue,该数据库是已报道海洋基因组数据库 Tara Ocean的3倍、蛋白序列库的60倍。

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  研究团队针对该基因数据库,利用深度学习算法工具进行挖掘,鉴定出了36个新型基因编辑系统,将助力中国在基因编辑工具使用上具有更多独立性和选择。

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  研究团队还鉴定了117个新型抗菌肽,并发现其中10个抗菌肽具有显著抗菌活性及广谱抗菌效果。该成果或将为抗生素耐药性难题提供新的解决方案。

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  研究团队还发掘了3个深海来源的高活性新型嗜盐PET塑料降解酶,3天内对PET薄膜降解率达到83%,是已报道的IsPETase塑料降解酶活性的44倍。

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  目前,GOMC数据库已存储于国家基因库生命大数据平台。

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  “这些发现不仅为全球科学家对海洋的可持续探索和利用开辟了广阔前景,也为未来的生物技术和生物医学研究奠定了基础。”文章共同第一作者、华大生命科学研究院陈建威博士说。(完)

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