|
0 v9 I0 E% ^* U! B- i
记者从近日举办的“千种海洋生物基因测序项目”暨全球海洋微生物基因库建设及应用成果联合发布会上获悉,华大生命科学研究院联合山东大学、英国东安格利亚大学等机构,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现大量具有应用潜力的基因资源。该研究为开发抗菌肽、新型基因编辑工具、PET塑料降解酶等提供了新思路。相关成果在线发表于国际学术期刊《自然》上。 7 R& y; y: c+ b! \
研究团队介绍,他们通过对已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了海洋微生物基因数据库GOMC。这一数据库拥有超4.31万个海洋微生物基因组和24.58亿个基因序列,是已报道海洋基因组数据库Tara Ocean的3倍。其中,2万多个微生物是潜在新发现物种,近1万个微生物为在深海等独特生境中首次发现。目前,该数据库数据已存储于国家基因库生命大数据平台。 4 c8 [$ t9 H; Z
论文通讯作者、青岛华大基因研究院院长范广益介绍,研究团队通过对数据库GOMC进行深度挖掘,发现了多项具有应用潜力的基因资源。其中,研究团队鉴定了36个新型CRISPR-Cas9基因编辑系统,并挖掘出一个具有潜在应用价值的新型Cas9编辑系统,为科研人员基因编辑工具使用提供了更多选择。
* e" L. i4 G8 {+ o( n' H 据了解,作为青岛自贸片区“千种海洋生物基因测序项目”第一年度重要成果,该项研究将助力海洋微生物的演化、生态学研究和遗传资源开发与利用。 & ^+ W, K, o H) \* S3 N
(记者宋迎迎 罗云鹏) 5 m- E2 E) ?) i. t
分享让更多人看到 1 D6 w0 g3 Z, g! d2 k
原标题:最完整海洋微生物 基因数据库出炉 来源:科技日报
8 y% b& [+ W1 n' ?; M( b% e5 N( m. x$ @% o% L1 I% u H6 s/ b1 G1 f F
* P- g4 q K9 J; k) E# N( m @2 b8 U4 k$ N9 [% j
7 I1 g4 @/ I4 t9 E# _( s, x0 C y5 ]- R# L9 b
* Y' Y: n9 g3 h6 B0 j
! v# o/ c8 v) o9 \6 _
. g1 i( p! ?$ G! o
! k6 N. T3 E. x) U. V' b2 f# R0 H' [
% _- ^" p* d5 a* D/ y3 \% B# d' [+ C
3 C# x- |1 A3 N' f _* r6 u
$ Z6 X2 f& t* k8 e! [1 c- _) W2 k& a
' A J* m: w0 w4 ?' ~7 z3 S
) L# Q1 K& t) C( W. X, x2 u
# }5 K. \" p5 W$ L: j8 H% W% s' H( T9 E) e3 u9 \5 I
! Z1 H% [, J D0 u [
! k; g1 S! B, v+ t: P" i9 K' ^
1 x$ b s' D! c7 `7 b
9 @$ v2 H. H+ v$ u
3 v3 c3 i( K0 S, x; C2 L
1 o% Q# a* R- d4 O1 P$ t* L5 |9 V& Z! U2 v" o! R- A9 c7 W+ D! _
1 ]; {% s' b9 A+ p2 a( C2 e- z3 m+ y( |6 {3 s
" x3 y& a% |. P2 r# @+ v
+ d" S3 v6 w# z; ^) l
A8 {4 D9 b7 K. Z
# J1 C2 S8 a. C* S( w
+ `5 \1 K/ ?& [1 }" l, ~% `
+ K( r: m5 R" ~' @# A
% B) V- f- R6 |2 y1 | A; R 海量资讯、精准解读,尽在新浪财经APP
* z+ C, d8 n; p* P- |( z 2 `/ Y+ e+ `2 i# G0 |- `. _
. g5 R+ r k; d- H/ z6 f0 Q- o6 {
1 c, x4 s$ t. Q
( X+ c+ D) }2 Q! C
0 W( ^+ S! Q0 F+ K& S0 h# F* t A6 `5 e) a
2 @3 Y1 |0 C% D$ H" K2 |5 i1 @
5 P& A. s" ^7 u' y
! k5 n* C" ^# ]8 A+ h5 p- E3 j- e. N) w) s7 B
9 K% T G3 y* G: o+ `
: O- T T8 D5 R
0 m& w* A y. R* {. u
) K4 C- p$ ~) X+ U |