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浅析sklearn中的数据预处理方法

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; a2 [1 [. D( c. b+ B( ^6 m

简介

$ A. t) Y; Q( V3 v( p# k7 i

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

! B1 Y8 Y$ h& Z

数据集准备

3 F4 z) ~& a2 F W+ T: U

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

) Y! j2 N& |- S0 ?) X. m
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集; ?$ a, \& M$ T# n8 d% z import numpy as np # f$ X# n. W' e6 j; a1 y( P4 s5 a- w! P# \7 q( _ iris = load_iris() # 特征矩阵 / x& Z0 W* b! }* t, E4 G( T2 Y print(iris.data.shape) # (150, 4) 7 a' s; N( v4 z5 ]& C print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] 1 U( d5 i9 o) [& v: F" F- B( s2 ~ print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]1 ~' ^9 @, M* Y5 }3 }1 c$ y
& t. o$ v0 c% G# Y4 A

无量纲化

6 J" X* d! z2 M4 G- e% M1 e' Q

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

* H* {4 ^& r' V0 Q$ ^8 a8 C

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

, {& r$ T7 P- }, j

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

! k; S- e1 @9 Y9 k' K

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

7 u1 C$ T1 g! a* h$ N! v7 y+ b9 h

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

7 A: t' A1 `' y$ E- n

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

6 m7 f- ~4 J: y- J

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

3 g8 [+ i: B! V+ W5 g( h

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

9 Q* Q" @$ G7 @; C6 D1 K, r

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

$ S, k' T; d3 b/ o2 D0 h3 z" h

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

# L# v. o Q0 U& J

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

6 A0 K1 B0 n% r/ t$ w# x! G, ~

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

- [) V3 |* \" N5 z8 D6 Y) X6 u
from sklearn.preprocessing import StandardScaler0 }7 z- X- I" M+ @7 x) F. A / @; x X; ~) `( v! x7 a7 b # 标准化,返回值为标准化后的数据$ p. ?5 K+ M$ e% N2 s& q1 T1 k standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)+ f4 C6 S) Y# H7 i print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]6 g- T1 u- [- f1 i
+ d! N W" E7 H

归一化-区间缩放法

' l* c7 v. m( j9 A( P

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

+ P# s4 g5 v$ s1 K3 {9 p, b6 D

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

, I8 W4 W5 R/ x8 p0 Y

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

) Z) Q1 c3 ?# h' _$ c- X$ @

常见用于神经网络。

9 t, U+ W0 @9 U" F% f

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

, U4 ?: V3 H) {( D1 E
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据( T6 w! Q4 i) r5 X o4 [$ V from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler! R7 t+ u0 W* u, w 9 l3 m# o" R* W9 o7 T1 T* i, s min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)1 N1 j$ _2 t' W2 E! t4 G4 c/ a7 x print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]5 u9 K- i/ N1 e3 K: W+ |+ \
& V( d8 m8 @1 N% o+ y! ^

正则化(Normalization)

- b1 _# O4 D/ \$ I( ?3 k

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

; Q3 }7 V( e/ O6 p7 L+ i

常见用于文本分类和聚类。

' ]& E# L2 l( w* l

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

k4 s3 u+ m, F; w9 j7 r* x" ` P

LpL_p范数的计算公式如下所示:

, u4 J0 C" S# J2 \: L4 Z3 @, _" N3 c

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

8 R, M x7 |. \9 ^

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

G& O- _ h# ^ J0 r( Y

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

. L+ B& b3 ?3 }" q& u2 |8 m! y

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

; _/ j- y0 I# c4 V( h/ h: V5 S

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

: l( \2 L. ~6 [& P% k! i7 }
from sklearn.preprocessing import Normalizer 0 a/ I! K1 g/ n( d& \& m8 ~ " m: L( g& r0 _ norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) ' M# T7 C+ J) @" ^. z4 y+ h2 ` print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] $ O; ?( @9 q/ F8 _
- ]) _, g! j) s% G7 S2 l

参数说明:

1 d0 h3 y+ F+ n' c

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

* H7 E- F: `0 L! @

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

( B1 n0 ]5 Q x: p+ t2 N* P

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

' P) D/ C) t, D! M W9 I8 I/ f. R

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

- u( |- h: c# C, O( {

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

8 z* y2 ]9 E+ C" G& |$ ~
from sklearn.preprocessing import Binarizer9 w9 T0 G# r' k" C3 X " \5 h( J+ }0 U* t5 L% H # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据9 ]1 q2 {: k5 d, x3 D binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) % M* u9 w% M0 T0 W5 u print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]& I8 @/ R/ ]8 _* D
! B) X( J5 F3 Z6 T- Z

对定性特征独热编码

: V, a4 ]# x' T3 U, I9 B' P* t* `# ~! f

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

2 B* ]% b% y% v# M0 R6 a v2 Y3 L

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

; t2 G" _) N/ z4 y

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

% D! E9 r2 x$ ?/ E2 P0 Y
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据9 c/ K1 J( r0 R |' e; Y from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder * S9 _/ Z; Z4 w import pandas as pd , r- _2 t0 G" q G3 b, `9 ^6 u' o- C# I% a/ x0 s0 W print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) # D/ X, g* D9 A. `% q* ^$ l one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))( |; \0 c0 v; ]6 x1 V( i print(one_hot.shape) # (150, 3)7 Y: d: b$ s4 _2 ?, g; R " |. B) l- e. \0 C dummy = pd.get_dummies(iris.target)+ O! Y% t7 Y3 V4 q print(dummy.shape) # (150, 3)! u% H$ c W% R% Z/ @( n! g9 u4 m
# T z% t0 w: C; Q/ p

缺失特征值补全

, E0 i$ L' M5 }

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

5 d3 S6 y/ m& f/ X% c

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

0 Z& A. c$ ^( z( p
from numpy import vstack, array, nan 2 |3 g n. X! J! j # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据2 y8 @& J A1 j9 y+ k4 T from sklearn.impute import SimpleImputer# S1 a8 w0 m1 f& f! u, B- L4 ?; J3 ^- A 1 S. H5 ?) |. C3 {1 h: l L # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN" M7 A; h1 E/ V7 m/ o) Z& c$ p# k # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) 6 V6 N+ y# U1 R# T u' x imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")0 w4 l+ {6 t2 U / ?* m& t* {/ e7 L% z1 ^9 I! f data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) + ?1 d9 B l; z. I2 }3 T( W/ O print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] & M1 }+ E P* n( i( P' ?7 @9 i result = imputer.fit_transform(data)( ?' D* z, S. M9 S4 r print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]0 Y5 {( z9 u4 a; e& u7 J$ J) s$ B8 @
) C( h- r3 k9 u) a: P7 N

数据变换

4 U, y5 b5 e9 N/ E5 B

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

+ \; q# r9 X8 u9 }

基于多项式的数据变换

4 I( U/ J7 u- _

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

0 ?- q6 H4 O7 Y2 K9 y0 H+ h

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

8 U C8 D0 i: i

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

" w' T; p( b$ f

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

. I& T3 {) w2 {) {/ y" N, O2 ^
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 & y. e9 @0 A: `. ?: I: v) [ # 参数degree,默认值为2 7 _/ Y$ I: l- X ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)7 e/ q. C" W. w" N- j% H! p/ R: } print(ploy.shape) # (150, 15) ( t5 h, J6 e5 Q8 ^4 g& R! r' W$ { print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] ! J1 W$ G8 t5 y- R
2 m! }' i7 }4 n" z6 t+ X, X

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

. J$ ^4 z0 p/ n/ p) F, K( Z9 r

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

2 i( I1 J8 W$ ]) D

基于对数函数的数据变换

4 b h9 M/ c/ b* v0 E

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

" u5 H4 v& K/ P! e% g

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

" `; q7 v6 Z3 y1 l: g" U: T
from numpy import log1p' Z' E! i- t# ? from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer) l5 V) M$ S; ]& L9 N% e/ N" N # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射9 U! R8 a% U3 k- k" d # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换4 [1 i' T0 A/ G' T; v! {1 ^, J # 第一个参数是单变元函数+ C, T* b/ ^# x: [( f* W+ A log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) ! j* B' T2 ]* H/ E! { print(log_one.shape) # (150, 4) 9 }- m0 [. b3 B r5 v Y8 o8 n print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]1 W. ?& N$ n! @! @* A
) c( G2 S! {) j; R, l8 W- `

总结

" n. K$ v# F, I. u. p

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

2 c% P- Y4 U' @- B( w
, |! H0 { b0 f6 f- r6 Z

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化+ U( M! d. C" q* m, T) I 9 U/ d$ c; ], \- |$ K1 ?4 P& S3 R) q1 ?) e 4 [# e u# b S8 F: s3 N6 z- @' w3 q, T1 \& `+ a3 q* I
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