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浅析sklearn中的数据预处理方法

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1 B9 @) }) ^9 N0 s5 j" S3 e

简介

5 E2 [- @. `4 U( t5 m4 Y- Y

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

2 l( O) Q- w5 Z5 V+ [& V

数据集准备

3 S& k. {4 F; J) [ E

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

3 j. X# m" |1 R3 L
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 / a" }' K. k8 J& a$ A! _ import numpy as np# n& w# J; D6 [: Q 0 ]3 o! p w+ \ t iris = load_iris() # 特征矩阵 9 Y/ ]0 N$ B. o$ \3 T print(iris.data.shape) # (150, 4) & [9 ]" j5 B u6 ]) k2 v+ m print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]], i/ ]9 [: p( L! i' P0 v, ^ print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]; X/ G5 g/ D( u* P- @$ p
2 [5 o% S' Z2 O! l7 E0 {. T, ^

无量纲化

+ |. A7 c. y. _0 I, z. ] f/ g' v: w

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

. d. _7 u1 R( ]( t+ ~( m

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

8 h- {' e$ B# Z* H3 d6 c0 m

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

9 f$ v B( [% M1 c1 e

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

' j% ?- Y' M1 w# s- R# S# I T( v

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

2 D; F- l7 `4 X( E: U# P

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

' Y$ e5 g) r2 o& `

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

! e" `& u& w5 d% @. i

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

) v; O3 g5 S& g6 N* h9 G$ a

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

) f6 s: R8 k) c' ]

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

( [9 S/ ~% l3 d; D% U

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

6 _2 \+ K. \$ u4 v5 z

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

3 i# U2 c* L* u; W% r
from sklearn.preprocessing import StandardScaler B$ e7 g2 _3 e% _: o. C6 ?2 }& G' W9 T+ H # 标准化,返回值为标准化后的数据& o2 n& x) H' O X+ M standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) % T' Z9 q# [8 G j print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] ' ]" G! M0 f- `; ^" \9 d
r- ~! R( o k+ O6 w8 m a) H; c& M

归一化-区间缩放法

a$ u6 h( G7 S- K& Q9 u# Q8 q

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

6 S3 M3 X& L- h6 g

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

) q6 n8 j+ }! a* M5 k

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

" C7 ?) ~3 c L7 t# {: `

常见用于神经网络。

5 H0 T3 Y0 p) e8 z- X

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

2 B/ v7 U& d7 f, h8 g1 R
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 ( y s; ^) o$ }4 b6 U- R/ M, B from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler , T% e# b5 ^( E+ B& Y2 x ( J1 z- Q, @: n3 ] min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)" T$ u! f' k9 v: T% v; k% Y print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]: T) [- U, p4 }8 _# @" f
. ^1 l3 n( v: k& ?9 Z

正则化(Normalization)

b& ^- W5 _. d& a7 k

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

4 [4 Y: k9 i/ u8 Y

常见用于文本分类和聚类。

0 I( r& p0 x% p+ ]+ J

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

+ m+ b3 |0 \/ p

LpL_p范数的计算公式如下所示:

4 i5 r' C, _5 ?; S% A; c& B- ?/ \

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

4 v( h6 S* O' [( x) \1 [7 a

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

1 I1 }$ h& m: N- n# S

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

' Q+ u8 L0 T3 h

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

% W' g# K1 F. ]4 j

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

2 I7 l/ o" R+ A# \
from sklearn.preprocessing import Normalizer ( D, p7 X" J7 k % G6 v1 b8 L4 O& c norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) / L1 N+ b7 B' Z; m print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] ' G( S" R c3 P% |. D+ w+ l9 C4 l
+ s5 `5 f' s3 E2 ^7 k

参数说明:

/ O: Z9 d( Q. x

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

0 q0 k% A$ q G& v/ s! |

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

6 g u2 u2 b$ y- i+ e) t

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

% m s# F$ m# o/ w7 F1 K

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

- A8 B* o) k0 h0 y

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

1 e7 G3 f5 X4 N, a+ r2 Z+ ?8 m
from sklearn.preprocessing import Binarizer $ B/ L* c& y3 @& o: \5 V. x1 M( ?1 c # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据6 _1 i I: P3 ~ Z0 i) B" K binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)2 F3 k0 M ?% S: M) K print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]$ v: p# o) R F2 z
/ o4 D# {* Q3 p

对定性特征独热编码

+ y# d, n: v8 ^( u

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

4 ]& ^: U' S: q' b/ p0 I

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

9 k6 w+ E$ A4 d

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

" q4 ~; Y9 f/ ]9 q# f( o5 D4 \
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据/ h1 o% p, a5 M1 F. T* U from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder : F/ k8 \9 q) F% F4 Z/ D9 S import pandas as pd * P7 n7 [. [; s s: N9 h, V& S: d. Y print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)# j$ e3 E0 V# F9 D one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)) 1 C' g& F h$ b( x( N: P print(one_hot.shape) # (150, 3) ! Q0 H/ a+ \) f c- I 0 F! u: R% K: \- c6 ] dummy = pd.get_dummies(iris.target) % Q, k/ R3 i# n( Q" h7 ], A, q print(dummy.shape) # (150, 3) % a6 L" d" Q$ c, k; }/ g
& p# c, Q$ k2 a+ O- W

缺失特征值补全

7 C% v! F6 u' C' {2 A( ^

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

4 |$ N5 {+ T, V. c8 w& {4 [6 f

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

& F7 p% o# f3 T2 {. O U+ m
from numpy import vstack, array, nan ^ c/ w1 ]8 t7 N9 T # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据0 A& ]; m# l/ ?( j# a( I from sklearn.impute import SimpleImputer 6 [1 F9 M2 |2 e$ {: ~% f6 m ! r) J3 D; s1 g8 H # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN7 g9 N/ o! ^" q. s+ K$ Z3 P # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)0 D y& ?) s) z4 B( R imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") 4 X& m# l3 e! n! r0 ~& P. a! H, a; R( r) Y' {( K* v' r: q7 e7 i data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)). x8 e0 D5 t& c1 k+ N5 P5 z* l, ? print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] `2 F; l W9 B1 } result = imputer.fit_transform(data)' c* i; }! Y3 K print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] ! p" U9 _0 ~1 \' a, b, H
0 p9 _" N7 }+ K% ?0 m0 V- C; z

数据变换

5 t% o5 F7 Z: ~/ w$ E

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

/ w9 y) ?. q9 D0 A) O4 [. v

基于多项式的数据变换

) A6 }+ k' j. m0 O' ~+ @+ |; z% ^

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

/ k# {: y/ U1 L" _

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

# Y% b8 P6 @7 z

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

4 C: _. E. w7 j% m

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

& O* c5 K! i Q0 X# Y$ o8 J" E) I
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换) Q- x! V3 H, a! O3 U5 U+ \2 R0 R # 参数degree,默认值为2 1 w/ S, F& v r* X7 e1 l ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)1 K6 S: x C. n' q print(ploy.shape) # (150, 15): G4 P/ z' R/ t: G print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] m1 m( n' W6 ?- d
$ x# @1 V/ _7 u1 \$ O

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

3 E- N" G6 ?6 t) v, Z

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

: u! Z' G! H- o5 U+ V- y

基于对数函数的数据变换

; C: \# c/ G* B- I" A

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

; I' T$ T4 v/ L) N9 K/ O

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

9 ~% b* \8 w3 E1 Q! L8 n
from numpy import log1p9 e* A0 I, m4 Y0 \ from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer 7 _. t4 S& A' i4 L# f # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射 & r3 z8 w( s+ f4 p # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换4 Q3 Y# } |: M" s3 A8 D+ O # 第一个参数是单变元函数 9 @. t$ p/ }8 n. r: M log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) # y* g& p4 x# L print(log_one.shape) # (150, 4)( y G! G2 b! k print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]* j2 i" v% @1 U4 U0 @( ~; a0 w
5 G7 h' L8 C: _7 u. H' B- j9 F% {

总结

( r4 `1 H+ h" P. d# c

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

H2 S' s; J5 I/ E0 b k
$ L& |3 S2 P* m9 Z p- v4 V! f, q

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化8 r" g, m, c% {8 w 6 H; \! c; ~& I& H0 f9 u' V5 o: I5 ^ * e5 m; r- [1 c( j0 l/ k , F7 w# I0 Y( c% o# K0 g: a! x
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