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浅析sklearn中的数据预处理方法

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# \! H( z* H- T* @5 g

简介

3 K2 s7 ~; \5 s6 [* t- h5 j7 t

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

4 j# K5 O2 o" }# Z8 t

数据集准备

; f1 x1 u5 A3 [2 q8 U; `6 g

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

* R5 g, q; p, D7 y
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 & i' c; p" b; M* a import numpy as np' a; [* }' M; i ! ?2 g2 |$ P4 u6 V iris = load_iris() # 特征矩阵7 L. x- r/ r& J7 L, l9 C print(iris.data.shape) # (150, 4) 9 d5 Z5 O* V T* [2 p, _ print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]) Y' b( {! j5 @3 `: o# ` print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]; c- U6 s3 [% r
6 L; R' J. H% V5 d7 p2 ?" H

无量纲化

% H& ?0 p# n& t' P; @, V1 a

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

- W/ J% m& c/ l6 Y) p

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

: }7 d2 U' r2 O6 L

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

, H' F# V9 |0 B% t

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

! C! u! I& d& R& M# v: z. |% y/ Y

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

5 @4 J& @( E$ q/ \1 G& z- P

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

7 M( K5 g9 z! o

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

- w3 Y+ c* j4 p4 G6 u

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

! D6 E0 \. ]9 E C7 J

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

( n/ r$ K/ X8 f

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

. C9 O8 d+ |: B+ |# P9 O( s- C

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

$ k P) b' L: l% t/ s- S

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

! p8 G7 {% Y! X2 T! s+ ?
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 5 c, t7 L5 }0 q( N3 D ! r/ y6 ~& h6 Z% P% [) \, h # 标准化,返回值为标准化后的数据' _& Q( }& U" \: I, s standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)0 ^7 S& L. o6 ]2 B print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] $ `4 t* w7 \- h X5 s3 F2 E
1 w9 p- Z. r9 ~& x; F) u

归一化-区间缩放法

) Q4 K% h! n. {) y$ z) x" k% z

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

! z3 O' i- K6 N3 I) h" E5 z( a

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

V$ d' r: Y+ | d

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

9 B" q' ^* V' e: a7 Q

常见用于神经网络。

+ G+ u( A, O4 P- F* D; i( J& k8 X/ }

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

1 x8 W+ W& W2 o2 K+ ` S* p( p y
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 9 n0 t5 \. x+ `) v- u4 x2 E from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler * L" F# [& W: p- m# |4 X , F& Z; \' a5 g4 C8 o min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) ' L! ]& m+ h0 W1 ?3 k# \+ f g$ ? print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]0 M" p' {, P3 Z8 G. X
" u0 O U5 v6 L: W3 Z' q4 ^

正则化(Normalization)

" f0 m4 y* S' U* B: i+ b* x

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

3 W" \4 d5 A) I' p- a2 Z

常见用于文本分类和聚类。

; p- ?0 l1 g' c' x( U! `

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

% G* Z: L' L7 B

LpL_p范数的计算公式如下所示:

+ S: F; x' z1 \2 l* r) f9 {0 X

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

\- Y( E* m$ L" x- t+ G- z% _* Z

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

" C/ P) @$ g3 \& Z

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

/ K6 X2 W2 z/ g2 I

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

8 P2 ~* I6 g# E! D

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

; [8 f+ |8 ?( `4 |
from sklearn.preprocessing import Normalizer+ R, F5 |* r& z: [8 { 3 p+ p8 U7 H# v" o- @, j) y M! Q norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data)+ C& S( H) c8 k/ e/ f print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]; {: j3 S: M" D
6 L. u: T& @3 t1 p' f

参数说明:

9 O2 u4 R4 G. M6 |+ @7 u0 z; A$ `

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

$ s2 d8 C5 t$ q

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

& d5 w6 {$ ~6 S2 r7 m! f% O& T

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

! c# F* H2 e" b. n0 \3 H5 H9 z

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

7 R$ F' [! ~1 I6 V; _0 n

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

7 o9 \# M2 M, [) y6 h3 E
from sklearn.preprocessing import Binarizer : K: w* X$ D' k0 E( y 5 ~1 S j1 S; P) F T # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据+ q- c$ t$ t4 P5 v binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)$ x# O8 X& {, A4 L% \ print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]2 @3 b, Q) t; ?" P( h7 Q
; d/ l7 Y7 ~0 _' Z

对定性特征独热编码

: H# _" K9 S% w, X

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

6 A& z; y' }. u: X

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

+ n+ u* z1 e- l6 s, q( `' `

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

1 ~( }% G9 R: o* w0 Y, Z3 E
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据0 S# E4 p' t" F% M5 y from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder 8 Y2 H2 u$ e( m- I import pandas as pd & W9 E3 ]% p- p+ u" n$ r 2 n0 |" X* A: i print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1): y, ^$ ]: y0 | one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))+ C1 F( ]4 }) Z* h7 E( r( p print(one_hot.shape) # (150, 3)$ r1 Q/ i' W. s; A) p2 S , M9 K. l- J. v$ K; l' q( i$ S dummy = pd.get_dummies(iris.target) + @, G5 E2 ~. w. o6 ^ print(dummy.shape) # (150, 3) [0 P9 L. [; q, N8 c
5 S0 N2 ^$ f) }$ ?8 S3 T% Z

缺失特征值补全

# I. m* Y4 _8 ^

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

% J( `; e: i, r9 G1 K" J& S

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

8 e! V3 J7 T# Y4 o( D; j
from numpy import vstack, array, nan * }4 p& H! Q( q* G # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据. p7 l/ F0 ^' Q6 c5 e g+ A from sklearn.impute import SimpleImputer" s- I+ S( q+ Z% v& v/ f. f M 7 T, V. t7 f" g# B # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN 2 t2 J! ~) N; U' ^0 _9 K5 T3 ] # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值). d" y$ V- l( Z% M$ a& Z% Z8 r imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") % C& w* m4 w3 `) G9 u2 G/ `& W J. d" ~) P& i data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) 8 S1 a) W! ]) z- V7 e print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] # C3 _) `! s' } result = imputer.fit_transform(data)3 \: B( x$ d- P& W* w print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]6 x, z- ~5 g: l- W& Z9 l$ \4 i* v
5 h H/ ?' E: o5 v8 F: V

数据变换

) V7 O& U/ ?) k% ^- c

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

3 S; x+ E, j5 R) x

基于多项式的数据变换

: b& j( b' t% N" o) Y9 Y6 V' g

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

6 {/ D2 g* t+ O0 T

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

% E( w6 ?$ j7 W7 z! d0 W

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

4 b# t4 z; s1 ?, b7 U1 y% P

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

+ ?3 {* ~* q/ E# ^0 y/ K; K* m9 H. `
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 " d8 P4 p1 F, K( A' m7 U! { # 参数degree,默认值为2, F( r' H; l# h7 V& Q! d ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) & e$ {! Q, T- h. D print(ploy.shape) # (150, 15) 1 [) `* m5 N3 j, I Q& d% O; d print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] & y J* e8 j3 R C0 ~$ X
, v M" R8 Z! [/ m

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

n7 u; a7 u5 i0 x+ f4 @% m

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

' Y: u1 S8 h' ~2 F4 A8 U! ]

基于对数函数的数据变换

1 n2 u. U% ~5 C+ K* g5 U

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

8 m: c/ _5 L+ L+ E

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

+ \, m; ~) m2 U
from numpy import log1p) S# t4 \( I3 _/ } from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer ; ^6 I2 S: O: t # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射 + y ~$ l% o" {; X8 q7 r3 F v # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换7 |$ n9 j! R+ Y/ x) J q # 第一个参数是单变元函数' V: Y* ?' r `0 s J1 S log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)! x9 _# }8 Y3 ?# I, r print(log_one.shape) # (150, 4), _+ O' g1 E8 v, r0 V& C print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] ( K% ^! h. i4 F" M* x) R2 p
# P! T4 k3 T/ v1 [* L

总结

/ t8 d% I5 e( r

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

- Y. Z: w$ ~! s. L+ y& a
. w5 ^3 k) _0 J3 t$ E% T5 A

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 ! g8 Y7 l! v& e0 M# U( t { ' b1 q3 q' k5 R! ^+ _" H ( h6 Z$ |- L7 e! w* U( l& E' ^* {9 q' _: U( t: D/ ^ $ Q$ a% g- s% x! T, ~8 c
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