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浅析sklearn中的数据预处理方法

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9 M7 X3 [+ J" B" W

简介

( u3 C( d7 u0 S1 O' r

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

8 y# F7 B4 X, d

数据集准备

, @( L. y0 D, Z7 M. x8 P' n

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

% |3 v$ V- S! O2 Z4 R
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 % C& f( x0 W4 N" M: `/ V$ [ import numpy as np* o# ~/ [7 {3 U 6 V& P1 p( S9 H iris = load_iris() # 特征矩阵; j# d8 k: K0 i print(iris.data.shape) # (150, 4) . b6 [& k" w; d6 F9 ~+ i. y+ f, b9 Y print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] % U$ U% E1 c0 D" T2 W; \ U print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] + q: d; Y' l3 ?- R, ]) e
9 g: ]- n% N: C

无量纲化

* `) v& }+ {# n

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

, M, ]' j. B, v6 t: c# L- f

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

, L0 W1 M/ w8 ]" @1 b) P

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

% O1 J# c Q: J0 n* J t3 P" o

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

, V- b, B9 W% x) R/ }+ K: m* F/ ^

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

1 d8 U4 @- C/ x* J+ z

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

8 @7 t1 u. q0 A4 P8 S/ v

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

8 @7 @6 @5 Z2 Q2 E( x! a% @

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

I7 G* r* F% o7 H8 P& X8 b L

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

0 ~& C* W* R9 p3 l1 r

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

! o; P' A3 x8 l

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

- }+ D5 p" c& f

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

5 R8 z0 D$ x# L' U' ~2 Y6 s, H
from sklearn.preprocessing import StandardScaler % ` H9 E* m9 W I. p4 O( x, t5 k7 B, T6 R' J, c* J6 Y6 I9 Z+ r # 标准化,返回值为标准化后的数据 ; S* a$ `; h9 [9 }: d% t standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)5 b3 N# x3 |; }6 b: X print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] ( x4 b9 C |5 h6 G9 I9 c
9 d2 \; }1 F) I7 J- f

归一化-区间缩放法

1 h1 w5 l. r, N

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

2 E. _2 ? C1 I& B6 P

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

; D6 a- G* s4 h; I0 o2 W7 W

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

) S1 l3 h) ^0 [, \: q1 ~

常见用于神经网络。

# f, y, \ J* X/ [7 R. o6 |

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

; A5 c: U6 w1 v
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 # y6 s' S% A0 ` from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler 1 z( V, i. w0 h. d" S+ L9 k% u 7 |$ }- b; ^" L0 E" C min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) ) _3 W/ O3 w+ R1 l1 w% i. T print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]0 Q/ c1 C1 X8 v$ p0 ]
: |7 z2 ?6 k0 O+ G* c

正则化(Normalization)

& D4 F4 L& V9 D) r4 P. Z+ U

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

1 |+ P- t% E+ I6 S4 N

常见用于文本分类和聚类。

1 u8 T% E! O3 S4 a" V" F

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

. h1 D/ d7 Y5 d' u: G/ s. Q) U

LpL_p范数的计算公式如下所示:

9 E1 h) m9 N- `8 [6 u' L( W3 A9 u2 P

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

5 U' z! ~$ d/ U# R: Q

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

; w) z. D n2 D. |% B! z# y' e

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

. o+ p) a5 A$ {* m7 m

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

Q1 Y' H/ s3 V8 @* G: g- }

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

% M6 N- v4 \2 S6 A: b
from sklearn.preprocessing import Normalizer; I2 U1 a, R/ R ! j c5 e* D7 C1 c5 k N. W+ o! h norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data), a, k C! e) q, w6 X! t9 B print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]8 V/ Q: o- C& A6 r
# J" T- r+ {" ~, s, z

参数说明:

' ?" F! L/ P3 e# I# j- ]

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

' Z! |8 C; V4 o4 i3 M. W2 S# `# l! M6 M

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

6 O) ~: {3 d3 E) |/ g

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

- t) Z L0 z2 D% M- p5 E2 y

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

. |( ~1 r0 U+ h6 { G

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

. z8 ]1 }4 t6 C2 I4 d2 o3 V5 W
from sklearn.preprocessing import Binarizer ) ]1 T' H' B* n( z$ g( j8 \1 Q) d3 w2 o # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据/ m, J% z" {0 v8 a8 Z# t binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) . v" T+ a: s; v; R9 n/ T print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]) q! ~6 r+ K, l+ u. m! w+ L
4 z. P( m$ D9 @% I( U

对定性特征独热编码

* D# k% c' ?) \7 p- M

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

; V$ t! P, i5 o+ r" W

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

: F9 I+ I* p7 r9 k. @% B

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

9 V2 J' \+ y! z$ M0 [% p
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 & g% t( T2 A W0 Q$ N; y, q; r! u from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder# o$ @0 L9 q6 Z0 b% h5 Z4 i& ` import pandas as pd 8 t; E; ?# T8 w h. @8 \ S t v; j; X. I5 L print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1): v l. q% y# s one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))! d1 J, n: I& x" n& x6 L- g5 E print(one_hot.shape) # (150, 3) 3 H0 Y" w, ^2 w2 ]# L! z' [$ a7 {! n( c! X+ K# L" c% P, K0 h8 K/ F dummy = pd.get_dummies(iris.target)" b; D9 ?2 F0 K3 D1 ~# @ G! E) B j1 | print(dummy.shape) # (150, 3)% c; m+ [1 m0 U }: T
" i0 W5 D5 v3 f2 u

缺失特征值补全

; R- u q- ?0 g5 h+ b; ~

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

* H# M; w7 l& ?" a" B) y. F, V, b6 [2 S2 B

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

0 Q( \( F5 x. k5 z3 T
from numpy import vstack, array, nan 2 ^# t) ~* P+ m2 A2 ^) e& k # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 + O1 a$ [0 t h9 V% g6 b! C from sklearn.impute import SimpleImputer ' j! |6 R0 n- ^. J( K u: } S6 D) {( Y, q" j B. U # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN : {' e, E- G8 P5 ~2 K( |; e" C # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) ! F/ [+ z4 J& o0 _( r( Y3 c# {. o imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") 2 ]' L7 r1 d0 F) L" W. `* H " u# }% m5 X$ _6 L0 C' Z data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) 1 S/ l4 @" w/ F# c print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] + U5 G1 p/ ]3 \ w1 A result = imputer.fit_transform(data). i- k: F% U. @. q [0 |+ E: s print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] # `( J, [% ]# M) l
2 u+ ~0 C9 M- V7 @. e$ p7 V

数据变换

& C- Y8 K1 a1 Q7 i/ z6 _

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

. C3 c" S9 R+ K* T" w Q

基于多项式的数据变换

6 \# S. T" N) {, T

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

/ G" W. U% D& c* Q$ R1 z

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

, K! l6 \# Y# t; }

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

* ]" o; |/ P" m; Y- M

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

1 j$ x( {# Z5 ?3 ]" \4 w0 n
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换9 X6 `) M! a& O0 _) }' Q% V # 参数degree,默认值为2 / O/ L. t$ e3 _# j! A ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) ! v; @7 F/ q9 X5 J) x1 N. O* _ print(ploy.shape) # (150, 15) W4 l, K1 d: a print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] 1 ]+ n. k r. M" Q7 R" x j' q3 j4 C
% L* @: ?: K4 x- g5 l* D+ H

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

; I7 y% U/ G: b2 A8 m. U- v: z

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

$ l' `* g% p. _

基于对数函数的数据变换

; J1 u3 p/ W1 w. ^1 [! D

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

( N, c* {+ p0 T0 K6 j2 W1 D

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

5 S3 u# E7 M4 C- H6 G0 [) O# B
from numpy import log1p7 V5 C8 l/ e7 ^ from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer " | \0 q* T0 R+ I" D6 I # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射. @ F0 A) r' J. Z # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 x, V3 K3 A9 a0 H- y # 第一个参数是单变元函数6 Y' m4 X+ o5 j* r* U log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) 4 s# T2 [8 k0 m- d) r. O print(log_one.shape) # (150, 4)6 `" H J5 ]' i! |, Z/ M4 ] print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]5 e8 s- f* {0 b' S, N% b
7 |: n: z3 v8 p5 b( b/ W

总结

8 P4 n$ C' J. G4 K* V" a; i, P' j

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

. x6 S v! X9 C* X! V2 [% A6 D* z
6 ?4 M3 e6 r. a0 A& M

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化$ i- m- C' k. g P0 y 3 N8 A9 f$ X: x7 q Z! ^3 \6 e6 D2 G' a8 w, }* `4 v9 b( } 5 c _' Q3 K# _8 K' G / k) Y: _& Q/ n2 i! q8 }
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