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浅析sklearn中的数据预处理方法

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5 w+ G, f; m: ~2 A9 @% N. u4 n- w

简介

" s3 m9 A) V* z4 ~5 H; s3 x

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

: Q' N1 s! S4 R: i, ~; \& R' W- V c

数据集准备

/ B1 {2 ? A; _' z! _- ^4 V

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

( z( b1 C( u9 F! N7 b# {" n" S
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集( t3 R- @% B7 i9 {# S3 A" i import numpy as np 8 i5 a6 D: i. T5 u ' a5 ~, f" u0 s; r- e$ C7 }, {* [ iris = load_iris() # 特征矩阵 5 w9 g L) b9 b6 ?" N* W6 R3 e print(iris.data.shape) # (150, 4)' k( N0 d$ Z& V8 d" G6 o/ k print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]6 L( a+ T% Y, P6 F* r+ L print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] 9 M# E% a- i- r- S/ X2 L9 A5 n
# H0 K, _0 w3 e/ t

无量纲化

' Z4 }1 R6 t0 c" k3 v( T0 M

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

7 O% Y) q& [; j. L3 A

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

: d5 n7 I- `2 k" a$ O4 h' G% j* O1 ?

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

+ @8 R7 Y- w' ~/ E

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

( E% t' }+ P. G$ a- h# {; q

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

5 K: a; j9 Z' s% e$ O

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

0 e- Z6 F x/ y6 b' v

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

& J' M& a. ~# @6 S' n2 Y

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

/ @# p! d; G! H9 u v6 a

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

" g" R. Q$ f( e: [5 d

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

# I7 h/ \& n+ c6 I/ P# p2 ^, a

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

, O1 {4 C' z T0 B( p

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

L$ V3 T' V- f0 Y
from sklearn.preprocessing import StandardScaler0 k- t4 [# ^9 P: ^5 A# c ' M2 M' k0 b( l7 E# k% E! H # 标准化,返回值为标准化后的数据 5 n2 A" o d; \3 e/ k' f standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data); p4 O7 T& z8 H6 r" ^+ h print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]6 C) Z a) P+ V6 f. k9 Y1 K# z
1 |+ j( s$ F- x) c

归一化-区间缩放法

2 y1 T ~% o7 q2 x% N: W

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

9 \, w% P$ D; @* m% ]6 V

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

, d" f3 Y2 d' w, p; m/ b' s

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

; h, u6 N$ |6 k

常见用于神经网络。

4 g+ q+ M: T# f3 D6 E. F c

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

3 l) U% C! W* `/ V M t; {
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据* V0 {- G; y% w" z from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler * n& C8 m+ Y1 y# J( V) h, c. ]* H8 L/ A* r5 H6 f5 \ min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)* D K7 T& {! o* X& H E print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] % {& A. h+ h' @6 ~7 E: j
* k- B! H8 I8 w3 n$ r: l# c u

正则化(Normalization)

( }% V& k' E. J, W! @4 x; b

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

) ^* d4 Y8 p$ x3 A9 h5 {! M

常见用于文本分类和聚类。

' G/ b5 u/ }% i

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

! E( H) ?4 b7 h+ Y- q K

LpL_p范数的计算公式如下所示:

! @3 S, L4 u- O

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

( ?% n% i2 m( N' }7 ?- M, U

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

- @3 q3 {# o/ e) t+ {

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

: }$ k' L8 O( S- A( G. v

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

7 g7 {( X' c! Z% z3 r4 r

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

" |6 Y1 G! ~) T N# h& z
from sklearn.preprocessing import Normalizer/ O& ]+ x! X3 A0 }) t7 X . R( c1 u* d# S0 S& L0 t norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data), p( z4 R, A( y% V7 A6 m" P print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]2 i; z P5 L" g: u' Z+ p
- c) Z \* t, O! R {/ f% f. W

参数说明:

5 S( H W: x9 \4 {# T8 d& V m

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

' T( B- p, T& i5 D( [

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

# m. P, u' V5 s

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

7 d3 E# Y4 H0 |; d

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

9 r! e% e" `& W6 {7 P H4 E

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

) O: n4 x3 }: A& \# p
from sklearn.preprocessing import Binarizer1 p/ w8 t B h5 [- j2 s+ m7 G+ {/ h 3 K+ F& |9 T6 y: ] # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据; F5 ]! N+ M0 Z, W/ E; \( L binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)$ }! h, j4 x$ X# \ print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] / X' n& r7 l6 W! X4 X
! D5 _, Z) T$ u. H

对定性特征独热编码

" u" G0 S& ^$ ]* h# K1 _* m

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

* B# x( z$ m& {2 r: I, K) k5 @

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

; D) m/ `, r) ]& @) p0 m5 v

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

* Z5 L! [5 Z' u M6 C V
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 3 [% q1 f( i' ]. n. ? from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder 0 H) Z( o5 T8 H% `+ m import pandas as pd( e* C0 q- `5 g% Q- Y / N& h8 C% q; A6 t0 s print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1); L8 g& M) n5 f8 J8 I) P# p: q6 I one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)). J8 k0 t' I1 a/ i! ]2 c8 V print(one_hot.shape) # (150, 3) ! k) k0 C- q/ a 8 p% ], ?& s% L5 Q dummy = pd.get_dummies(iris.target)6 I/ P9 ?9 G; m- H% m' M print(dummy.shape) # (150, 3) # p! H# W; }$ a* s7 U
# V$ o: d+ n% ^( R

缺失特征值补全

$ Z( w4 _ P" I& I

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

4 [0 Z1 w X( U/ ?' t& o* Y4 Y7 `

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

; s5 M/ n0 X- t4 m) _
from numpy import vstack, array, nan + I5 ]. d' ^/ Q # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 0 h- C7 a4 o7 h) r from sklearn.impute import SimpleImputer: _2 x. i% {' q/ y' {* T9 S $ s" j& e# W; u" B/ X # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN2 ~8 `5 Q. W! X, q# M # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) 0 b) H! \2 x! J6 f& f imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")# R2 }9 o4 B4 I# I* H ; H5 ~. r: |# u5 W; c* Y data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))' F2 T- E- E9 U: ]8 k3 R. ` print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]]4 _9 k& {% K. ~& X1 g result = imputer.fit_transform(data)" Z; O* S( k8 W/ z/ t# L print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]: B1 E. U$ E! K; @. |. ?( V: c
1 S& u6 E4 S) H+ ~

数据变换

( F# ?2 S3 r# u' K+ e1 v

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

2 F+ A8 N" w* l, d1 j- R \

基于多项式的数据变换

$ Q: C% M: x% _1 r

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

2 K; L1 o* G3 k" q

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

5 W- V# H. K1 R2 B9 N

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

# q& m+ Z& r4 W6 | Z) u

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

) o8 D" w/ y2 f9 g8 Z
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 ; H& {9 c' _* M5 O # 参数degree,默认值为2 , a1 U5 w$ m1 e$ s1 ?9 T ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)( c' [7 e' w; f& M5 E8 `" C print(ploy.shape) # (150, 15)0 u: ~6 O( O) [/ P6 l' A print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]]9 G* m: }7 h) F; S1 a
/ F# m0 `, E1 x

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

+ ~& N/ l: L7 A

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

4 A1 Q* Z- {' x: p7 Q

基于对数函数的数据变换

/ R m" {) @4 d& `8 M3 @

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

, H# B k8 r/ c( g( Q

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

3 C. O) e) Y6 c- K
from numpy import log1p + l! z/ q8 [9 Z) ?! C2 _ from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer, X. ?+ @4 P/ D) q% r/ O& c/ W8 G # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射6 y" e+ b4 @1 i# j. I7 Z # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 5 h) N' O/ o6 O% I( u& D # 第一个参数是单变元函数 + I7 `. o; x" d9 E! h: l log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) " X T6 o& }% O: j* e) p7 E print(log_one.shape) # (150, 4) 1 n: z$ k) ~! ~+ v5 ]& _6 S print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]# l' t( l7 S0 x3 H% R. j9 [% N( J
6 }" o& \' w5 W% }- K

总结

7 U, i" p. N5 N+ k# h4 t. b* D ?

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

- h' I' U d* a5 l: k! F5 D0 H
% Q3 D# d$ u$ [. b1 x1 u6 ], _

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化6 L# O# d( H& {+ I8 a, s 9 \7 w0 h. }' c+ `- [2 ] ! u9 g5 V9 T- ^5 ]2 a1 w7 M4 ? 7 a' {2 y: a6 _: d+ {6 w; P! c% x4 \ * q7 d. G- s& D' D6 \, x
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